Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3P62908 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3P62908 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms