Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFNP31947 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFNP31947 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFNP31947 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFNP31947 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFNP31947 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFNP31947 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFNP31947 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFNP31947 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFNP31947 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFNP31947 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFNP31947 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms