Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD53P19397 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD53P19397 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CD53P19397 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CD53P19397 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD53P19397 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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