Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SH3BP1Q9Y3L3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SH3BP1Q9Y3L3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SH3BP1Q9Y3L3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SH3BP1Q9Y3L3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SH3BP1Q9Y3L3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1Q9Y3L3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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