Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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