Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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