Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms