Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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