Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms