Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E9PBE3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E9PBE3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms