Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palm3A2TJV2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms