Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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