Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms