Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms