Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms