Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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