Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms