Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFNP31947 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFNP31947 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFNP31947 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SFNP31947 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFNP31947 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFNP31947 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFNP31947 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SFNP31947 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFNP31947 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFNP31947 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFNP31947 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFNP31947 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFNP31947 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFNP31947 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFNP31947 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFNP31947 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFNP31947 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms