Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PCH4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PCH4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PCH4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PCH4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PCH4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms