Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf172C9J069 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms