Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms