Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR2

KRTAP4-5, Keratin-associated protein 4-5, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-5Q9BYR2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-5Q9BYR2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms