Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc185Q3V118 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc185Q3V118 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc185Q3V118 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc185Q3V118 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc185Q3V118 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ccdc185Q3V118 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ccdc185Q3V118 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ccdc185Q3V118 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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