Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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