Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms