Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
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