Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPLO60437 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPLO60437 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPLO60437 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms