Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms