Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms