Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPC1L1Q9UHC9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms