Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF3RQ99062 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms