Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SAMD8Q96LT4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SAMD8Q96LT4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SAMD8Q96LT4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SAMD8Q96LT4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD8Q96LT4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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