Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP13Q92995 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP13Q92995 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP13Q92995 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP13Q92995 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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