Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Stx18Q8VDS8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx18Q8VDS8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx18Q8VDS8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx18Q8VDS8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx18Q8VDS8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx18Q8VDS8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx18Q8VDS8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms