Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG7

DENND6B, Protein DENND6B, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND6BQ8NEG7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND6BQ8NEG7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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