Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms