Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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