Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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