Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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