Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMF1P82094 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMF1P82094 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMF1P82094 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMF1P82094 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMF1P82094 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMF1P82094 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms