Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TspoP50637 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TspoP50637 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TspoP50637 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms