Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB1P11230 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms