Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3542K7N6U2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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