Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl8Q9Z121 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms