Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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