Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms