Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms