Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms