Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBC1D3CQ6IPX1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms