Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms